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程时锋

  

  程时锋研究员

  Email: chengshifeng@caas.cn

  

  学习经历

  2013/09-2016/12  香港大学生物信息学,获博士学位

  2008/09-2011/07  深圳大学基因组学,获硕士学位

  2004/09-2008/07  湖北大学生物科学,获学士学位

  

  工作经历

  2018/10-现在, 中国农业科学院农业基因组研究所, 合成生物学研究中心, 研究员

  2017/01-2018/09, 华大基因研究院, 深圳华大基因研究院, 资深科学家

  2011/07-2013/08, 华大基因研究院, 深圳华大基因研究院, 信息高级工程师

  

  程时锋,研究员,博士生导师。国家自然科学基金委优秀青年科学基金获得者,中国农业科学院“青年英才”, 深圳市国家级领军人才。主要从事植物比较进化基因组学和作物群体遗传学等基础性研究工作,发起和主持全球“谷-豆“基因组联盟协助组,并建立以“小麦”和“豌豆”为标杆的禾本科及豆科模式研究对象。在围绕“植物是如何获得新性状及其分子遗传演化机制”这一科学问题中,从物种水平(Phylogenomics)、群体水平(关联分析及连锁分析)、以及关键表型性状的多组学ENCODE等不同时空维度展开研究工作,重点课题包括结瘤共生固氮、C4/CAM高光效、真核生命及光合植物起源、作物进化驯化大历史等,并开展基因组大数据指导下的作物新品种选育、培育等分子育种及应用工作。相关研究成果以第一或通讯作者(含共同)发表在Science(2篇)、CellNature BiotechnologyPlant Cell等杂志10篇,共发表SCI论文36篇,他引9000多次。多次主持国际学术研讨会并作报告,审稿<Nature Communications>、<Trends in Plant Science>等多篇文章。

 

  代表性论文: *第一作者  通讯作者

  1. Cheng S*, Wong G, Melkonian M. Giant DNA viruses make big strides in eukaryote evolution. Cell Host & Microbe (2021). https://doi.org/10.1016/j.chom.2021.01.008

  2. Cheng S*, Xian W, Fu Y, et al. Genomes of Subaerial Zygnematophyceae Provide Insights into Land Plant Evolution. Cell, 2019, 179(5): 1057-1067. e14.

  3. Griesmann M, Chang Y, Liu X, et al. Cheng S†. Phylogenomics reveals multiple losses of nitrogen-fixing root nodule symbiosis. Science, 2018, 361(6398): eaat1743.

  4. Cheng S*, Melkonian M, Smith SA, et al. 10KP: A phylodiverse genome sequencing plan. Gigascience. 2018;7(3):1–9.

  5. Cheng S*, Gutmann B, Zhong X, et al. Redefining the structural motifs that determine RNA binding and RNA editing by pentatricopeptide repeat proteins in land plants. Plant J. 2016;85(4):532–547.

  6. Lin S, Cheng S*, Song B, et al. The Symbiodinium kawagutii genome illuminates dinoflagellate gene expression and coral symbiosis. Science. 2015;350(6261):691–694.

  7. Cheng S*, van den Bergh E, Zeng P, et al. The Tarenaya hassleriana genome provides insight into reproductive trait and genome evolution of crucifers. Plant Cell. 2013;25(8):2813–2830.

  8. Zhang, G., Liu, X., Quan, Z. Cheng S*. et al. Genome sequence of foxtail millet (Setaria italica) provides insights into grass evolution and biofuel potential. Nat Biotechnol 30, 549–554 (2012).

更新于2021年3月

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