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猪基因组组装成果正式发布

2023-08-23 11:00:00来源:

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8月18日,由全国畜牧总站主办的2023畜禽种业发展论坛在太原盛大开幕。由中国农业科学院深圳农业基因组研究所及佛山鲲鹏现代农业研究院唐中林研究员团队主导的猪基因组组装成果在论坛上发布。

猪基因组组装成果发布会现场


团队采用PacBio HiFi、Hi-C、PacBio ISO-seq等最新测序方法和Hifiasm、NextPolish、Purge Haplotigs等最新组装技术,组装的藏猪和香猪(从江香猪)参考基因组具有连续性好、完整性及准确性高等优点。

藏猪(CZ)、香猪(XP)和杜洛克(Duroc)基因组共线性图


新组装猪基因组与已发表猪基因组连续性对比



基因组组装质量评价


据悉,2021年,全国畜牧总站组织国内的优势科研队伍,开展猪、牛、羊、鸡、鸭、鹅等我国特有品种的参考基因组构建专题工作,日前经国内权威专家论证,已经完成藏猪、香猪参考基因组的构建。


实施畜禽精准鉴定项目中参考基因组组装专题,是实现畜禽种业振兴行动目标的重要举措之一。藏猪、香猪参考基因组的建立,不仅为获取本品种更多的遗传信息,深入解析其独特优势,挖掘特色优质基因,助推本品种开发利用奠定基础,也为研究我国地方猪优异的遗传特性,提供了具有自主知识产权的中国坐标、中国标准,对开展畜禽基因组研究、特有经济性状解析、分子遗传改良实施和种质资源创制具有重要意义。


畜禽分子坐标项目专题工作推进会


唐中林研究员团队合照


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