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第三届“大鹏湾”功能基因组学暑期夏令营火热报名中!

2025-05-12 02:51:00来源:

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我们诚挚邀请您参加第三届“大鹏湾”功能基因组学暑期夏令营,活动定于2025年6月23日至27日在深圳举行。该项目致力于推动统计方法在人类疾病功能基因组学研究中的应用,通过精密的统计框架建立遗传变异与生物学功能的桥梁。

本强化课程历时五天,将系统讲解现代基因组学在复杂疾病分析全流程,从基础统计遗传学概念进阶至前沿多组学技术。课程内容涵盖全基因组关联分析(GWAS)、分子数量性状基因座(QTL)定位与精细定位策略,延伸至单细胞分析、空间转录组学及GWAS-多组学数据整合。贝叶斯模型与机器学习方法将作为核心分析技术贯穿课程。学员将通过方法原创者的专题讨论深化理论理解,并辅以实践操作环节提升技术应用能力。

课程主要面向从事医学研究的初级科研人员、研究生、临床工作者,以及动植物遗传学、数量遗传学和流行病学科研人员。学员需具备遗传学与基因组学基本知识。基于往届学员反馈,在提供完整代码进行上机实操的基础上,2025年课程特别增设为期一天的纯统计学视角的基础统计遗传建模专题课程,旨在夯实方法论基础以支持后续高阶基因组学应用。

本次邀请的授课老师均来自于国际著名高校,且在群体遗传学和功能基因精细定位领域开发的软件为业界的主流软件,因此,本次授课也将为广大相关科研工作者提供和他们建立联系,以及近距离交流解惑相关科研问题的重要平台。

中农芯跃(深圳)生物科技有限公司

中国生物信息学学会青年工作委员会

2025年5月

 

  1. 一、课程概况

主办单位:中农芯跃(深圳)生物科技有限公司

协办单位:中国生物信息学学会青年工作委员会

上课形式:线下(深圳、限定60名)

上课日期:2025年6月23日-6月27日

上课地点:广东省深圳市大鹏新区鹏飞路7号D栋101

报名截止日期:2025年6月15日(满员即止)

 

二、课程亮点

1、国际顶尖师资,零距离交流合作

授课专家来自哈佛大学、芝加哥大学、哥伦比亚大学、密歇根大学等全球顶尖学府,均为GWAS、贝叶斯模型、空间组学等领域的开拓者!课程中特设一对一答疑及研究问题探讨环节,学员可直接与专家对话,获取个性化指导,甚至孵化合作课题!

2、前沿技术全覆盖,实战赋能科研

从GWAS到单细胞/空间组学,5天系统学习国际最前沿技术:

(1)贝叶斯模型与机器学习核心应用

(2)分子QTL定位、TWAS、孟德尔随机化

(3)单细胞与空间组学数据分析实战

课程提供完整代码与云端计算环境,手把手助你打通理论与实操!

3、专属学术社交圈,拓展科研人脉

与60位同领域青年学者共聚深圳,与顶尖专家面对面交流,搭建长期合作桥梁!

4、新增基础强化课,夯实方法论根基

特设1天统计遗传建模专题,从零梳理核心模型,助力后续高阶研究!

5、在山海之间,探索基因奥秘

课程选址大鹏湾畔,亲近金沙湾海浪,远眺七娘山云霞。聚焦研讨前沿技术,闲暇漫步金色沙滩——在天然氧吧中激发科研灵感,让海风拂去思维壁垒、让知识吸收更高效!



 三、学术协调

王告,博士,哥伦比亚大学神经疾病科学助理教授

 

四、授课专家

贺信,博士,芝加哥大学人类遗传学副教授

周翔,博士,密歇根大学生物统计学教授

葛天,博士,哈佛医学院/麻省总医院副教授,Broad研究所副研究员

王告,博士,哥伦比亚大学神经疾病科学助理教授

董睿,博士,哥伦比亚大学医学院讲师

苑锴,博士,哈佛医学院/麻省总医院讲师

 

五、课程安排

2025年6月23日  星期一

时间

主讲

主题

8:30-8:40

王告

课程概述

时间

主讲

主题

8:40-12:00

董睿

频率论统计学基础

(1)统计遗传学基本量:关键量的数学表述。包括基因型表示、次等位基因频率(MAF)、哈迪-温伯格平衡(HWE)、连锁不平衡(LD)与LD评分、遗传相关性/亲缘关系的数学表达
(2)线性回归基础:固定效应与随机效应视角的线性回归模型
(3)荟萃分析与统计量:关联检验统计量、它们与LD结构的关系、荟萃分析基础模型
(4)逻辑回归与混合模型:比值与比值比、简单逻辑回归模型及其与比值比的关系、线性混合模型原理
(5)回归分析中的协变量:混杂因子、碰撞因子与中介因子的分类及其对回归分析的影响

12:00-13:00  午餐

时间

主讲

主题

13:00-16:50

董睿

贝叶斯统计学基础

(1)似然比检验:遗传模型假设检验中的应用
(2)贝叶斯正态均值模型:贝叶斯建模基础
(3)贝叶斯与频率学派比较:遗传学研究中的方法论比较
(4)贝叶斯多元正态模型:相关联表型与遗传效应的多元建模
(5)贝叶斯模型比较:通过贝叶斯多元正态模型介绍混合模型与模型平均方法

时间

主讲

主题

17:00 – 18:30

刘安京;董睿

实践操作与计算环境配置(可选)

根据学员个人情况,本环节为可选参加内容:
(1)在讲师和助教指导下完成基础统计学的上机课堂练习;(2)配置后续课程的计算环境

 

2025年6月24日  星期二

时间

主讲

主题

8:30-12:00

苑锴

遗传关联研究基础

(1)基因组学核心概念:二倍体人类基因组结构、基因组织架构、孟德尔与复杂性状的遗传变异机制,单体型与连锁不平衡原理
(2)GWAS方法论概述:从早期混合遗传理论到现代多基因模型的演进,高密度SNP分型技术、GWAS研究设计要点、单体型标记、基因型填充、关联分析方法及孟德尔随机化框架

12:00-13:00  午餐

时间

主讲

主题

13:00-16:30

苑锴;王告

遗传关联精细定位

(1)精细定位策略:多基因区域连锁不平衡的影响、频率学派与贝叶斯可信集构建方法、跨群体数据整合策略
(2)精细定位进阶专题:基于汇总统计量的实践要点、非GWAS场景下的拓展应用、SuSiE与FINEMAP的局限性及替代方案

时间

主讲

主题

16:40 – 17:20

刘安京

上机实践指导

基因型数据质控、亲缘关系与群体结构分析

17:20 – 17:50   讲师晚餐

时间

主讲

主题

17:30 – 19:00

刘安京;王告

实践与答疑(可选)

可选内容:(1)技术问题咨询:刘安京;(2)研究问题探讨:王告一对一交流

 

2025年6月25日  星期三

时间

主讲

主题

8:30-12:00

葛天

遗传力与复杂性状预测

(1)遗传力与遗传相关性分析: 双生子研究、家系研究、广义和狭义遗传力、SNP遗传率、线性混合模型和遗传力估计(GCTA)、LD评分回归、病例对照研究的易患性阈值模型、遗传相关性的量化方法
(2)多基因风险评分: GWAS汇总统计量质量控制、经验阈值法、贝叶斯方法、跨种族预测与临床转化

12:00-13:00  午餐

时间

主讲

主题

13:00-16:30

葛天;苑锴

现代GWAS应用

(1)生物样本库进行基因组研究:生物库的概念和各种类型、主要资源概述、表型组关联分析(PheWAS)、电子健康档案、生物标记物与影像学数据整合
(2)案例研究:大型GWAS项目实例

时间

主讲

主题

16:40 – 17:20

刘安京

上机实践指导

分子QTL入门

17:20 – 17:50   讲师晚餐

时间

主讲

主题

17:30 – 19:00

刘安京;王告

实践与答疑(可选)

可选内容:(1)技术问题咨询:刘安京;(2)研究问题探讨:王告一对一交流

 

2025年6月26日  星期四

时间

主讲

主题

8:30-12:00

贺信

分子QTL定位与GWAS整合

(1)分子QTL定位:分子性状及定位的原理、RNA-seq数据表达量化、数据标准化、显性与隐性协变量校正、多重检验校正
(2)GWAS整合分析:转录组学数据和GWAS整合分析概述、转录组关联研究(TWAS)、共定位分析、孟德尔随机化与因果TWAS

12:00-13:00  午餐

时间

主讲

主题

13:00-16:30

贺信;王告

利用功能基因组学进行GWAS后分析

(1)功能注释:编码影响和非编码调控效应的策略、深度学习注释工具、功能类别遗传率富集分析
(2)多基因分析:基因和通路水平整合和解释GWAS发现的方法、基因水平关联检验(VEGAS/MAGMA)
(3)其他分子QTL分析:多组织、多组学QTL(xQTL)数据概述、xQTL及GWASxQTL整合策略

时间

主讲

主题

16:40 – 17:20

刘安京

上机实践指导

分子QTL精细定位、TWAS与MR

17:20 – 17:50   讲师晚餐

时间

主讲

主题

17:50 – 19:00

刘安京;王告

实践与答疑(可选)

可选内容:(1)技术问题咨询:刘安京;(2)研究问题探讨:王告一对一交流

 

2025年6月27日  星期五

时间

主讲

主题

8:30-12:00

周翔

贝叶斯模型与机器学习前沿

(1)贝叶斯方法:GIFT/FABIO因果基因识别、IMAGE甲基化QTL整合、跨祖先精细定位
(2)机器学习:DBSLMM/mtPGS多基因评分、跨种群多基因评分、贝叶斯非参数预测、CoCoNet共表达网络整合

12:00-13:00  午餐

时间

主讲

主题

13:00-16:30

周翔

单细胞与空间组学分析

(1)单细胞分析: VIPER数据补全、VIPCCA多组学整合、FastCCC细胞通讯推断
(2)空间组学: SPARK空间变异基因检测、CARD空间解卷积、SpatialPCA空间域识别

时间

主讲

主题

16:40 – 17:20

王告

上机实践指导

QTL与GWAS整合方法实践

17:30 结课总结与反馈收集

 

六、培训费用及优惠政策

培训费:4000元/人(此费用包含培训费及资料费,食宿需自理)

* 组团报名有优惠:2人报名享9折,4人及以上报名享8折。

 

七、缴费方式

您可以采用“对公转账”或“支付宝”的方式缴纳报名费,备注“单位,姓名,人数”(示例:某某大学张三李四2人),并将转账凭证上传至问卷,后台会有专人在3个工作日内审核,审核通过后会邮件告知并提供开票指引。

(1)银行转账收款账户信息:

账户名称:中农芯跃(深圳)生物科技有限公司

银行账户:7640 7635 1724

开户银行:中国银行深圳大鹏支行

(2)支付宝收款账户信息:1823509300@qq.com

 

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八、注意事项

(1)课程实操:请参会学员自己携带笔记本电脑,实操部分将使用课程提供的计算环境配置,可以兼容个人MacOS,Windows及Linux操作系统。我们鼓励学员们在个人电脑上配置及完成所有练习,以便课后回顾及后续个人课题研究。

(2)有兴趣在个人电脑上配置课程数据分析环境的学员,请在参加计划之前访问https://wanggroup.org/compbio_tutorial/course_setup,按照说明设置笔记本电脑。课程同时提供备用云端计算环境。

(3)所有课程以中文讲授,教材资料均为英文版本。

(4)上课座位将按报名顺序从前到后依次安排。

 

九、联系方式

联系人:苏女士

联系邮箱:suluanxin@caas.cn

联系电话:18598019167(微信同号)

 

十、酒店住宿

深圳奥登国际酒店(大鹏金沙湾店)

距离培训地点:2.6公里

预定方式:预定请直接联系欧阳经理13434415878,报课程名字可享下方专属协议价!


房型价格表

房型

价格(间/夜)

豪华大床房(含早)

350

豪华双床房(含早)

350



 

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