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研究平台

  

基因所计算中心以实现大规模农业生物信息学计算为中心任务,推动形成农业海量生物组学大数据储存、整合与挖掘研究体系,为实现农业生物大数据的深度挖掘奠定基础,以超算和大数据两个中心推动学科建设。

建设历程:

建设时间

计算峰值

存储能力

资金来源

备注

2014年5月

35TFloops

1PB

自筹经费

2T超大内存节点2台,高性能节点60台

2016年7月

15TFloops

1.5PB

深圳市农业表型和利用重点实验室

1T超大内存节点1台,高性能节点16台

功能作用:

  (1)计算资源呈梯子配置,根据节点内存配置划定三大功能分区,其中大内存(1T以上)节点可满足复杂大基因组的组装;普通节点分区可满足基因数据和表型数据分析等诸多应用。

  (2)存储资源分区采用普通存储+分布式并行存储并存模式,存储分区可以为基因数据库等提供海量存储空间。

  (3)计算功能分区和存储分区网络采用56Gb/s Infiniband FDR高速互联,高速互联网络的搭建为存储提供高达300000IOPS/秒及超过20Gb/s的聚合带宽,为实现生物大数据的深度挖掘奠定基础。

  (4)计算平台以IDC机房要求打造我所高性能机房机房环境、供电系统、空调系统、布线系统、网络系统、KVM 系统、网管系统、网络安全系统等基础架构,通过电信和移动双专线的互联模式对外提供云计算服务。

开放共享:

       为贯彻落实《国务院关于国家重大科研基础设施和大型科研仪器向社会开放的意见》(国发〔2014〕70号)精神及根据《科技部办公厅关于2016年全面落实〈国务院关于国家重大科研基础设施和大型科研仪器向社会开放的意见〉相关工作安排的通知》(国科办函基〔2016〕333号)要求,结合我所实际,计算平台实行开放式共享原则。

     根据《基因组所大型仪器设备对外开放共享办法》和《基因组所计算平台管理办法》要求,建立成本核算和服务收费管理机制,为院所内外各单位生物学研究提供技术支持、高性能计算和海量存储资源。

     联系方式:ruanjue@caas.cn

 

科技管理处更新于2020年7月

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